Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5A1P25705 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5A1P25705 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5A1P25705 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5A1P25705 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5A1P25705 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5A1P25705 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5A1P25705 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5A1P25705 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5A1P25705 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5A1P25705 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5A1P25705 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5A1P25705 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5A1P25705 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5A1P25705 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5A1P25705 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5A1P25705 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP5A1P25705 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5A1P25705 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5A1P25705 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5A1P25705 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5A1P25705 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5A1P25705 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5A1P25705 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5A1P25705 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5A1P25705 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5A1P25705 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5A1P25705 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5A1P25705 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5A1P25705 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5A1P25705 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5A1P25705 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5A1P25705 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5A1P25705 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5A1P25705 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5A1P25705 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5A1P25705 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5A1P25705 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms