Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CA4P22748 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA4P22748 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA4P22748 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA4P22748 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA4P22748 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA4P22748 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA4P22748 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA4P22748 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA4P22748 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CA4P22748 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA4P22748 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA4P22748 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA4P22748 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA4P22748 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA4P22748 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA4P22748 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA4P22748 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA4P22748 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA4P22748 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA4P22748 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA4P22748 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA4P22748 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA4P22748 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CA4P22748 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA4P22748 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA4P22748 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CA4P22748 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CA4P22748 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CA4P22748 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA4P22748 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA4P22748 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CA4P22748 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA4P22748 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA4P22748 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA4P22748 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA4P22748 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA4P22748 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CA4P22748 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA4P22748 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA4P22748 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA4P22748 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CA4P22748 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA4P22748 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA4P22748 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA4P22748 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA4P22748 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA4P22748 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA4P22748 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA4P22748 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA4P22748 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA4P22748 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA4P22748 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA4P22748 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA4P22748 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CA4P22748 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA4P22748 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA4P22748 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA4P22748 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA4P22748 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA4P22748 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA4P22748 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA4P22748 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA4P22748 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA4P22748 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA4P22748 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CA4P22748 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA4P22748 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA4P22748 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CA4P22748 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA4P22748 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA4P22748 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CA4P22748 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA4P22748 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA4P22748 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA4P22748 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA4P22748 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA4P22748 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CA4P22748 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA4P22748 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CA4P22748 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA4P22748 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA4P22748 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA4P22748 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CA4P22748 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA4P22748 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA4P22748 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA4P22748 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA4P22748 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA4P22748 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA4P22748 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA4P22748 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA4P22748 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA4P22748 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA4P22748 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA4P22748 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA4P22748 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CA4P22748 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CA4P22748 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA4P22748 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms