Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYL1P12980 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYL1P12980 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYL1P12980 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYL1P12980 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYL1P12980 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYL1P12980 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYL1P12980 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYL1P12980 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYL1P12980 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYL1P12980 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYL1P12980 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LYL1P12980 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LYL1P12980 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LYL1P12980 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LYL1P12980 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LYL1P12980 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LYL1P12980 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LYL1P12980 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LYL1P12980 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYL1P12980 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYL1P12980 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYL1P12980 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYL1P12980 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYL1P12980 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYL1P12980 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LYL1P12980 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYL1P12980 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYL1P12980 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYL1P12980 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYL1P12980 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LYL1P12980 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LYL1P12980 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LYL1P12980 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYL1P12980 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYL1P12980 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYL1P12980 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYL1P12980 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYL1P12980 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYL1P12980 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYL1P12980 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYL1P12980 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYL1P12980 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYL1P12980 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYL1P12980 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYL1P12980 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYL1P12980 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYL1P12980 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYL1P12980 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYL1P12980 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYL1P12980 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYL1P12980 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYL1P12980 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LYL1P12980 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYL1P12980 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYL1P12980 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYL1P12980 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYL1P12980 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYL1P12980 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYL1P12980 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYL1P12980 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LYL1P12980 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYL1P12980 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYL1P12980 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYL1P12980 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYL1P12980 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYL1P12980 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYL1P12980 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYL1P12980 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LYL1P12980 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYL1P12980 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYL1P12980 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYL1P12980 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYL1P12980 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYL1P12980 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYL1P12980 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LYL1P12980 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYL1P12980 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYL1P12980 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LYL1P12980 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYL1P12980 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYL1P12980 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYL1P12980 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYL1P12980 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYL1P12980 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYL1P12980 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms