Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UPK3BL2E5RIL1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPK3BL2E5RIL1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms