Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DKK2Q9UBU2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms