Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CELF4Q9BZC1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms