Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3Q8N5Y2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSL3Q8N5Y2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms