Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL8

PRAMEF19, PRAME family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF19Q5SWL8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF19Q5SWL8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF19Q5SWL8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF19Q5SWL8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms