Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FXNQ16595 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FXNQ16595 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FXNQ16595 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FXNQ16595 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FXNQ16595 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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FXNQ16595 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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FXNQ16595 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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FXNQ16595 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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FXNQ16595 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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FXNQ16595 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXNQ16595 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXNQ16595 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXNQ16595 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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FXNQ16595 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXNQ16595 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXNQ16595 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXNQ16595 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXNQ16595 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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FXNQ16595 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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FXNQ16595 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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FXNQ16595 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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FXNQ16595 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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FXNQ16595 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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FXNQ16595 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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FXNQ16595 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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FXNQ16595 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FXNQ16595 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FXNQ16595 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FXNQ16595 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FXNQ16595 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FXNQ16595 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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