Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CSTF3Q12996 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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