Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
GRIN2AQ12879 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms