Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3P05106 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB3P05106 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms