Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMNAP02545 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNAP02545 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNAP02545 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNAP02545 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNAP02545 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNAP02545 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNAP02545 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNAP02545 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNAP02545 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNAP02545 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNAP02545 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNAP02545 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNAP02545 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNAP02545 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNAP02545 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNAP02545 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNAP02545 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNAP02545 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNAP02545 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNAP02545 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNAP02545 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNAP02545 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNAP02545 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNAP02545 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNAP02545 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNAP02545 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNAP02545 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNAP02545 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNAP02545 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNAP02545 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNAP02545 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNAP02545 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNAP02545 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNAP02545 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNAP02545 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNAP02545 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNAP02545 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNAP02545 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNAP02545 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNAP02545 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNAP02545 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNAP02545 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNAP02545 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNAP02545 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNAP02545 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNAP02545 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNAP02545 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNAP02545 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNAP02545 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNAP02545 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNAP02545 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNAP02545 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNAP02545 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNAP02545 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNAP02545 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNAP02545 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNAP02545 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNAP02545 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNAP02545 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNAP02545 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNAP02545 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNAP02545 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNAP02545 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMNAP02545 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNAP02545 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNAP02545 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNAP02545 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNAP02545 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNAP02545 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNAP02545 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNAP02545 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNAP02545 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNAP02545 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNAP02545 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNAP02545 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNAP02545 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNAP02545 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNAP02545 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNAP02545 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNAP02545 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNAP02545 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNAP02545 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNAP02545 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNAP02545 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNAP02545 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNAP02545 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNAP02545 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNAP02545 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNAP02545 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNAP02545 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNAP02545 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNAP02545 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNAP02545 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNAP02545 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNAP02545 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNAP02545 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNAP02545 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNAP02545 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNAP02545 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms