Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB6O95452 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB6O95452 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB6O95452 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB6O95452 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB6O95452 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB6O95452 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB6O95452 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB6O95452 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB6O95452 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB6O95452 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB6O95452 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB6O95452 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB6O95452 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB6O95452 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB6O95452 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB6O95452 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB6O95452 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB6O95452 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB6O95452 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB6O95452 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB6O95452 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB6O95452 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB6O95452 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB6O95452 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB6O95452 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB6O95452 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB6O95452 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB6O95452 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB6O95452 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB6O95452 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB6O95452 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB6O95452 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB6O95452 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB6O95452 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB6O95452 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB6O95452 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB6O95452 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB6O95452 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB6O95452 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB6O95452 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB6O95452 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB6O95452 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB6O95452 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB6O95452 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB6O95452 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB6O95452 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB6O95452 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB6O95452 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB6O95452 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB6O95452 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB6O95452 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB6O95452 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB6O95452 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB6O95452 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB6O95452 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB6O95452 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB6O95452 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB6O95452 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB6O95452 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB6O95452 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB6O95452 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB6O95452 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB6O95452 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB6O95452 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB6O95452 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB6O95452 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB6O95452 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB6O95452 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB6O95452 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB6O95452 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB6O95452 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB6O95452 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB6O95452 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB6O95452 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB6O95452 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB6O95452 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB6O95452 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB6O95452 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB6O95452 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB6O95452 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB6O95452 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB6O95452 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB6O95452 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB6O95452 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB6O95452 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB6O95452 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB6O95452 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB6O95452 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB6O95452 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB6O95452 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB6O95452 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB6O95452 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB6O95452 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB6O95452 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB6O95452 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB6O95452 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB6O95452 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB6O95452 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB6O95452 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms