Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYNCRIPO60506 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCRIPO60506 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms