Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms