Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARID3CA6NKF2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARID3CA6NKF2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
ARID3CA6NKF2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms