Protein–RNA interactions for Protein: A6NIJ5

FAM90A20P, Putative protein FAM90A20P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A20PA6NIJ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM90A20PA6NIJ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM90A20PA6NIJ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms