Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRRDQ9UH36 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRRDQ9UH36 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRRDQ9UH36 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms