Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0B6

CCDC167, Coiled-coil domain-containing protein 167, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC167Q9P0B6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC167Q9P0B6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC167Q9P0B6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC167Q9P0B6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC167Q9P0B6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC167Q9P0B6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC167Q9P0B6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC167Q9P0B6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms