Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SACSQ9NZJ4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SACSQ9NZJ4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms