Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
THSD1Q9NS62 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THSD1Q9NS62 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THSD1Q9NS62 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THSD1Q9NS62 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
THSD1Q9NS62 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
THSD1Q9NS62 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THSD1Q9NS62 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THSD1Q9NS62 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THSD1Q9NS62 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms