Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH2D3AQ9BRG2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SH2D3AQ9BRG2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH2D3AQ9BRG2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms