Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLMNQ96JQ2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLMNQ96JQ2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLMNQ96JQ2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLMNQ96JQ2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLMNQ96JQ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLMNQ96JQ2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLMNQ96JQ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLMNQ96JQ2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLMNQ96JQ2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms