Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
STRCQ7RTU9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
STRCQ7RTU9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms