Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFCAB12Q6NXP0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EFCAB12Q6NXP0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms