Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC01545Q5VT33 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01545Q5VT33 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms