Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKN3Q16667 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN3Q16667 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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