Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2C1P98194 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2C1P98194 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2C1P98194 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.4 ms