Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCP4P48539 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCP4P48539 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCP4P48539 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCP4P48539 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCP4P48539 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCP4P48539 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCP4P48539 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCP4P48539 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCP4P48539 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCP4P48539 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCP4P48539 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCP4P48539 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCP4P48539 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCP4P48539 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCP4P48539 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCP4P48539 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCP4P48539 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCP4P48539 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCP4P48539 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCP4P48539 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCP4P48539 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCP4P48539 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCP4P48539 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCP4P48539 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCP4P48539 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCP4P48539 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCP4P48539 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCP4P48539 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCP4P48539 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCP4P48539 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCP4P48539 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCP4P48539 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCP4P48539 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCP4P48539 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCP4P48539 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCP4P48539 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCP4P48539 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCP4P48539 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCP4P48539 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCP4P48539 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCP4P48539 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCP4P48539 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCP4P48539 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCP4P48539 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCP4P48539 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCP4P48539 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCP4P48539 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCP4P48539 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCP4P48539 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCP4P48539 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCP4P48539 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCP4P48539 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCP4P48539 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCP4P48539 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCP4P48539 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCP4P48539 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCP4P48539 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCP4P48539 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCP4P48539 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCP4P48539 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCP4P48539 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCP4P48539 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCP4P48539 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCP4P48539 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCP4P48539 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCP4P48539 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCP4P48539 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCP4P48539 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCP4P48539 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCP4P48539 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCP4P48539 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms