Protein–RNA interactions for Protein: O15498

YKT6, Synaptobrevin homolog YKT6, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YKT6O15498 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YKT6O15498 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YKT6O15498 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YKT6O15498 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
YKT6O15498 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YKT6O15498 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YKT6O15498 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YKT6O15498 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YKT6O15498 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YKT6O15498 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YKT6O15498 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YKT6O15498 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YKT6O15498 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YKT6O15498 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YKT6O15498 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YKT6O15498 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YKT6O15498 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YKT6O15498 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YKT6O15498 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YKT6O15498 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YKT6O15498 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YKT6O15498 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YKT6O15498 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YKT6O15498 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YKT6O15498 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YKT6O15498 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YKT6O15498 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YKT6O15498 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YKT6O15498 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YKT6O15498 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YKT6O15498 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YKT6O15498 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YKT6O15498 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YKT6O15498 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YKT6O15498 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YKT6O15498 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YKT6O15498 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YKT6O15498 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YKT6O15498 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YKT6O15498 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YKT6O15498 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YKT6O15498 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YKT6O15498 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YKT6O15498 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YKT6O15498 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YKT6O15498 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YKT6O15498 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YKT6O15498 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YKT6O15498 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YKT6O15498 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YKT6O15498 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YKT6O15498 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YKT6O15498 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YKT6O15498 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YKT6O15498 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YKT6O15498 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YKT6O15498 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YKT6O15498 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YKT6O15498 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YKT6O15498 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YKT6O15498 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YKT6O15498 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YKT6O15498 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YKT6O15498 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YKT6O15498 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YKT6O15498 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YKT6O15498 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YKT6O15498 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YKT6O15498 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YKT6O15498 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YKT6O15498 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YKT6O15498 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YKT6O15498 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YKT6O15498 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YKT6O15498 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YKT6O15498 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YKT6O15498 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YKT6O15498 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YKT6O15498 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YKT6O15498 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YKT6O15498 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YKT6O15498 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YKT6O15498 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms