Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC27A2O14975 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC27A2O14975 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC27A2O14975 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms