Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD1B0YJ81 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms