Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2C9

TLR6, Toll-like receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR6Q9Y2C9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR6Q9Y2C9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR6Q9Y2C9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms