Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSAQ9Y285 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSAQ9Y285 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSAQ9Y285 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSAQ9Y285 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FARSAQ9Y285 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 620.7 ms