Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM167BQ9NRX6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM167BQ9NRX6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms