Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
YTHDC2Q9H6S0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
YTHDC2Q9H6S0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC2Q9H6S0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC2Q9H6S0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC2Q9H6S0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC2Q9H6S0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC2Q9H6S0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC2Q9H6S0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC2Q9H6S0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC2Q9H6S0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC2Q9H6S0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC2Q9H6S0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
YTHDC2Q9H6S0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
YTHDC2Q9H6S0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
YTHDC2Q9H6S0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms