Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3CQ99985 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms