Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00615Q96LM1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00615Q96LM1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00615Q96LM1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms