Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX27Q96GQ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX27Q96GQ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms