Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATRIPQ8WXE1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATRIPQ8WXE1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATRIPQ8WXE1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms