Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN3Q16667 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN3Q16667 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms