Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIF1AQ16665 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIF1AQ16665 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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