Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP3Q02447 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SP3Q02447 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP3Q02447 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP3Q02447 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SP3Q02447 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP3Q02447 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP3Q02447 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP3Q02447 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP3Q02447 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP3Q02447 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SP3Q02447 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP3Q02447 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SP3Q02447 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SP3Q02447 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SP3Q02447 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SP3Q02447 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SP3Q02447 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SP3Q02447 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SP3Q02447 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP3Q02447 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP3Q02447 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP3Q02447 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP3Q02447 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SP3Q02447 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP3Q02447 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP3Q02447 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SP3Q02447 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SP3Q02447 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SP3Q02447 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP3Q02447 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP3Q02447 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP3Q02447 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP3Q02447 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP3Q02447 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP3Q02447 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP3Q02447 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP3Q02447 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SP3Q02447 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SP3Q02447 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP3Q02447 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP3Q02447 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP3Q02447 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SP3Q02447 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP3Q02447 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SP3Q02447 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP3Q02447 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP3Q02447 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP3Q02447 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP3Q02447 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP3Q02447 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP3Q02447 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP3Q02447 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP3Q02447 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SP3Q02447 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP3Q02447 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP3Q02447 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SP3Q02447 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP3Q02447 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP3Q02447 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP3Q02447 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SP3Q02447 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SP3Q02447 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SP3Q02447 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SP3Q02447 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SP3Q02447 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP3Q02447 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP3Q02447 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP3Q02447 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP3Q02447 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SP3Q02447 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP3Q02447 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP3Q02447 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP3Q02447 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP3Q02447 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP3Q02447 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SP3Q02447 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP3Q02447 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP3Q02447 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms