Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
RANGAP1P46060 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RANGAP1P46060 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RANGAP1P46060 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms