Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ITGAEP38570 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ITGAEP38570 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ITGAEP38570 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms