Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3P05106 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3P05106 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms