Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB4AP04350 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms