Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL3O95236 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL3O95236 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL3O95236 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL3O95236 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL3O95236 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL3O95236 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL3O95236 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL3O95236 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL3O95236 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL3O95236 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL3O95236 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL3O95236 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOL3O95236 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL3O95236 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL3O95236 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL3O95236 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL3O95236 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL3O95236 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL3O95236 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL3O95236 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL3O95236 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL3O95236 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL3O95236 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL3O95236 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL3O95236 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL3O95236 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOL3O95236 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL3O95236 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL3O95236 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL3O95236 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL3O95236 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL3O95236 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL3O95236 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL3O95236 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL3O95236 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOL3O95236 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL3O95236 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL3O95236 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL3O95236 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL3O95236 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL3O95236 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL3O95236 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL3O95236 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL3O95236 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL3O95236 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL3O95236 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL3O95236 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL3O95236 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOL3O95236 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
APOL3O95236 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL3O95236 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL3O95236 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL3O95236 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL3O95236 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL3O95236 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL3O95236 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL3O95236 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL3O95236 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOL3O95236 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOL3O95236 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOL3O95236 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOL3O95236 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOL3O95236 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOL3O95236 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOL3O95236 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOL3O95236 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOL3O95236 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOL3O95236 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOL3O95236 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOL3O95236 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOL3O95236 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOL3O95236 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOL3O95236 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOL3O95236 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOL3O95236 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOL3O95236 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOL3O95236 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOL3O95236 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOL3O95236 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOL3O95236 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOL3O95236 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOL3O95236 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOL3O95236 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOL3O95236 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms