Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCRIPO60506 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNCRIPO60506 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms